一般的甲狀腺水囊十分常見，尤其是小於一厘米的甲狀腺水囊，大部份都没有病徵，所以大部份人都不會察覺。

而甲狀腺內佈滿微絲血管，當水囊表面的微絲血管出現流血，血液會流入水囊之中，令水囊突然變大和產生疼痛，這個情況稱之為出血性水囊，病人會感到甲狀腺位置突然疼痛及腫脹。大部分出血性水囊都會在三至四星期内明顯變小。

經過臨床觸診後，醫生一般會建議病人進行甲狀腺超聲波檢查，來分辨甲狀腺水囊或其他甲狀腺狀況如甲狀腺結節或癌症等。同時，醫生可以以超聲波導引進行甲狀腺水囊幼針穿刺，以抽取水囊內的細胞作病理化驗，分辨甲狀腺細胞的性質。

經確診後，大部份的出血性甲狀腺水囊都可以觀察處理，而大部分出血性水囊都會在三至四星期内明顯變小。但如果患者感到甲狀腺有嚴重的腫痛感覺，醫生可以為您進行幼針穿刺抽取甲狀腺水囊內積存的血水，再輔以非類固醇消炎藥物 (Non-Steroidal Anti-Inflammatory Drugs)，以紓緩症狀。

另外，每隔半年至一年的甲狀腺超聲波檢查可以觀察甲狀腺水囊有否不正常的變化。如果甲狀腺水囊在超聲波檢查之下有明顯的大小或影像變化，醫生可能會再安排超聲波導引幼針穿刺抽取細胞作化驗。